Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trim24Q64127 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trim24Q64127 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trim24Q64127 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trim24Q64127 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trim24Q64127 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim24Q64127 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms