Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Col4a5Q63ZW6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col4a5Q63ZW6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms