Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Ndufa4Q62425 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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