Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prkd1Q62101 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms