Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rai1Q61818 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rai1Q61818 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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