Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trim25Q61510 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trim25Q61510 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trim25Q61510 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim25Q61510 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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