Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ecm1Q61508 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms