Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamb3Q61087 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamb3Q61087 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms