Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms