Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CttnQ60598 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CttnQ60598 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CttnQ60598 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms