Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3aQ60520 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms