Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf145Q5SWK7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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