Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85aQ5SP85 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms