Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Fam208bQ5DTT3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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