Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc3lQ4KL14 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms