Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shank3Q4ACU6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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