Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx25Q3ZT31 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx25Q3ZT31 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms