Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc9a2Q3ZAS0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms