Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Carmil2Q3V3V9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Carmil2Q3V3V9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms