Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC051142Q3V0M8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BC051142Q3V0M8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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