Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms