Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms