Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm5460Q3UQ97 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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