Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp30Q3UN04 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp30Q3UN04 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp30Q3UN04 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp30Q3UN04 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms