Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp19Q3UJD6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms