Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf224Q3UIW8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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