Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms