Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek10Q3UGM2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek10Q3UGM2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms