Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q3U6N9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q3U6N9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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