Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ssbp4Q3U4B1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms