Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LcorlQ3U285 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LcorlQ3U285 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms