Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms