Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrriq3Q14DL3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms