Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms