Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Cnn1Q08091 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Cnn1Q08091 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Cnn1Q08091 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Cnn1Q08091 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms