Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hspg2Q05793 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Hspg2Q05793 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms