Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sox12Q04890 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms