Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nf1Q04690 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nf1Q04690 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nf1Q04690 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nf1Q04690 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nf1Q04690 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nf1Q04690 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nf1Q04690 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Nf1Q04690 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nf1Q04690 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms