Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms