Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl7Q03366 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms