Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms