Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms