Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top2aQ01320 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms