Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EgfrQ01279 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EgfrQ01279 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms