Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja5Q01231 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms