Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Itga4Q00651 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms