Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Il6stQ00560 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms