Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SmsP97355 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SmsP97355 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SmsP97355 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SmsP97355 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SmsP97355 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SmsP97355 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SmsP97355 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SmsP97355 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms