Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Arf1P84078 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms