Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cbx1P83917 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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